Усовершенствование методов диагностики возбудителя бактериального ожога риса на основе ПЦР

Егорова М.С.; Игнатов А.Н.; Мазурин Е.С.

Усовершенствование методов диагностики возбудителя бактериального ожога риса на основе ПЦР

Егорова М.С., Игнатов А.Н., Мазурин Е.С.

Дата публикации в реестре: 2020-03-03T14:18:22Z

Аннотация:

На основе анализа оригинальных и ранее опубликованных последовательностей ДНК Xanthomonas oryzae pv. oryzae были разработаны праймеры для ПЦР «в реальном времени», позволяющие достоверно идентифицировать возбудителя бактериального ожога риса, без перекрестных реакций с близкородственными видами. Была оптимизирована среда для БИО-ПЦР YPGA, содержащая в качестве селектирующих факторов антибиотики циклогексимид 50 мг/л + цефазолин 30 мг/л + гентамицин 2 мг/л. Показано, что чувствительность праймеров при БИО-ПЦР с использованием оригинальной селективной питательной среды в 100 раз эффективнее прямого ПЦР анализа. Оптимизированная БИО-ПЦР диагностика возбудителя бактериального ожога риса позволяла обнаружить 50 КОЕ/мл семенного экстракта.

Ключевые слова:
БАКТЕРИАЛЬНЫЙ ОЖОГ РИСА, BACTERIAL LEAF BLIGHT OF RICE, ПЦР "В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ", БИО-ПЦР, BIO-PCR, REAL-TIME PCR

Тип: Article

Права: open access

Источник: RUDN Journal of Agronomy and Animal Industries